在陕甘边革命委员会成立前后，陕甘游击队于1932年4月1日拂晓再次发起攻打山河镇的战斗。由于缺乏攻坚火力，攻城两日未克，陕甘游击队遂撤出战斗。4月3日上午，陕甘游击队在山河镇以东10余公里的西坡坳伏击增援山河镇之敌，击毙四五十人。战后，陕甘游击队返回寺村塬。4月12日，根据总指挥部奔袭旬邑县城的决定，陕甘游击队离开寺村塬，向旬邑方向进发。新成立的陕甘边革命委员会由于失去革命武装力量的依托而停止活动。

　　在此之前，中共陕西省委于3月21日向中共中央报送了《游击队逐渐壮大情况及准备成立正式红军的请示》。此后，陕西省委指派省委书记杜衡前往陕甘边地区巡视工作。4月中旬，杜衡到达陕甘交界的旬邑、正宁一带，同行的还有刘志丹、黄子文等。4月18日，杜衡在旬邑县马家堡陕甘游击队驻地召开会议。杜衡在讲话中不切实际地指责游击队犯了政治错误，宣布撤销陕甘游击队总指挥部，并宣布撤销谢子长的总指挥一职。会后，谢子长被派往甘肃靖远从事兵运工作。在这次会议上，杜衡宣布将陕甘游击队分编为第三支队和第五支队。第三支队支队长刘志丹、政委高维翰、参谋长吴岱峰、供给主任刘约三。第五支队支队长阎红彦、参谋长杨重远。

　　会后，鉴于国民党当局调集重兵“围剿”陕甘游击队，两个支队决定避实就虚，分头行动，以打击国民党军队。刘志丹率第三支队向永寿、礼泉、乾县一带活动。阎红彦率第五支队前往三原县武字区，配合当地游击队开展斗争。

　　第三支队和第五支队分别进入关中西路和渭北地区后，广泛开展游击战争，引起了国民党地方当局的恐慌，遂调集重兵分三路进行“围剿”：一路从三原、泾阳一线向北进攻；一路从彬县、旬邑一线向东进攻；一路从甘肃正宁、宁县一带堵截。在此形势下，中共陕西省委命令第三支队与第五支队集结于旬邑清水原。

　　5月10日，中共陕西省委决定恢复陕甘游击队总指挥部，总指挥刘志丹，政委高维翰，参谋长杨重远，政治部主任黄子文。刘志丹兼任第三支队支队长，高维翰兼任第三支队政委。阎红彦仍为第五支队支队长。中共队委会也随之恢复，由高维翰任书记。